Instituudi struktuur

Administratsioon ja üldpersonal (direktor Toomas Saat; +372 671 8901, +372 508 8438 (5093), asedirektor Georg Martin)
Meresüsteemide osakond (juhataja Robert Aps; +372 671 8942, +372 506 2597)
Merebioloogia osakond (Georg Martin; +372 671 8936)
Kalabioloogia ja kalanduse osakond (Markus Vetemaa; +372 515 3269 (5096)
Pärnu osakond (Erki Aavik)
Ökodünaamika osakond (Henn Ojaveer; +372 443 4456), postiaadress: Lootsi 2a, Pärnu 80012
Kaugseire ja mereoptika osakond (Tiit Kutser; +372 671 8947 )
Kalanduse teabekeskus (Toomas Armulik; +372 5039276)